Лаборатория радиационной биологии ОИЯИ и Южно-Уральский государственный университет разработали прототип интеллектуальной системы для анализа поведенческих паттернов мелких лабораторных животных: https://www.jinr.ru/posts/oiyai-i-yuurgu-razrabotali-..

Лаборатория радиационной биологии ОИЯИ и Южно-Уральский государственный университет разработали прототип интеллектуальной системы для анализа поведенческих паттернов мелких лабораторных животных: https://www.jinr.ru/posts/oiyai-i-yuurgu-razrabotali-..

Новое программное обеспечение (ПО) основано на нейросетевых алгоритмах для автоматизированной обработки видеоданных. Прототип ПО автоматизирует рутинные операции подсчета движений крыс в экспериментах с использованием специализированных стендов ЛРБ, снижает фактор субъективности при распознавании и классификации и в то же время обращает внимание на моменты, в которых требуется взгляд специалиста.

Поведенческие тесты – неотъемлемая часть проведения экспериментов с животными. Для оценки влияния ионизирующего излучения на грызунов используется специально оборудованная комната с установками Т-лабиринт, «Открытое поле», водный лабиринт (тест Морриса) и другие (НПК Открытая Наука, Россия). В ходе проведения поведенческих тестов в ЛРБ используется программа Noldus EthoVision XT 13.0 (Noldus, Wageningen, the Netherlands), которая позволяет сделать видеозапись эксперимента, после чего возможно получения данных о трекинге – весь путь, проделанный грызуном в установке, а также получить данные по тепловой карте, то есть узнает, в каких участках установки животное бывало чаще всего. Однако до появления прототипа интеллектуальной системы количество различных поведенческих актов: заглядываний в норки, замираний, поднятий, груминга, движений на месте и т. д. – приходилось считать вручную. Совместно с коллегами из ЮУрГУ получены первые результаты по обучению нейронной сети распознанию на видеозаписях таких паттернов, как груминг, стойки, норки. Результаты анализа предоставляются в удобном формате для хранения и проверки корректности определения поведенческих актов, с возможностью их калибровки по продолжительности актов (длинный/короткий груминг).